Historiquement, on peut affirmer que la paroisse réformée de Neuchâtel naquit  le 4 novembre 1530, jour mémorable où le rite catholique romain fut aboli à une courte majorité. Le bouillant Réformateur Guillaume Farel ayant quitté la ville pour Morat après un séjour marquant de quelques mois, le Conseil de Ville nomma comme premier pasteur le Lyonnais Antoine Marcourt, docteur en Sorbonne, pamphlétaire parfois violent. Le temps des ruptures a fait heureusement place au temps des rapprochements et de l’unité chrétienne encore recherchée et déjà vécue.

En effet, l’œcuménisme n’est pas un vain mot à Neuchâtel entre les paroisses catholiques, la paroisse orthodoxe et la paroisse réformée, sans oublier telle ou telle Église évangélique. En faisant preuve d’esprit de création et d’innovation en plusieurs domaines (cultes, catéchismes, manifestations culturelles, etc.), la paroisse de Neuchâtel ne vise pas le recrutement de nouveaux membres mais souhaite susciter l’intérêt de l'ensemble de ses habitants.